В Crysis присутствует большой выбор транспортных средств; большинство из них доступны игроку. Доступные наземные средства передвижения включают много техники, начиная с лёгких джипов и заканчивая тяжёлыми танками. К морским средствам передвижения относятся лёгкие моторные лодки, суда на воздушной подушке и подводных крыльях. Во всех транспортных средствах (пикапах, хаммерах и даже танках) есть режим ускорения, который активируется нажатием соответствующей клавиши. Выбор летательных средств лимитируется одним северокорейским боевым вертолётом и вымышленным американским летательным аппаратом вертикального взлёта и посадки — VTOL (англ. Vertical Take-Off and Landing — Самолёт вертикального взлёта и посадки), каждый из которых способен транспортировать небольшие военные отряды.

Колёсные транспортные средства имеют зональную систему повреждений, что наиболее заметно на примере простреливаемых шин. В гусеничных транспортных средствах, таких как танки или БМП, возможно уничтожение гусениц. Также можно выстрелить во внешние топливные канистры для их детонации и последующего подрыва транспортного средства; пылающий остов будет наносить ущерб всем объектам поблизости своей высокой температурой. Даже если все шины транспортного средства пробиты, оно всё ещё может медленно ехать на ободах колёсных дисков. То же самое относится к гусеничным транспортным средствам, в которых уничтожены гусеницы. К средствам, которые есть в игре, но не могут использоваться игроком, относятся реактивный самолёт, экскаватор и большие суда. Сюда относятся и все инопланетные средства.

Находясь внутри транспортного средства, игрок имеет возможность обзора как от первого, так и от третьего лица. Во втором случае игрок также имеет возможность вращать виртуальную камеру обзора приблизительно на 45° влево и вправо от линии направления движения транспорта. Также в режиме третьего лица имеется возможность отдалять и приближать виртуальную камеру.

Важно отметить, что существенное количество транспортных средств доступно для игрока только в мультиплеере. Например, такая техника, как вертолёт, зенитная самоходная установка, гусеничная БМП, колёсный бронетранспортёр, судно на воздушной подушке и подводных крыльях, недоступна или ограничена в синглплеере.

Бронетранспортёр — амфибия

В игре присутствует одно скрытое транспортное средство — плавающий бронетранспортёр-амфибия (англ. amphibious Armoured personnel carrier – APC). По функциональности бронетранспортёр очень похож на БМП: то же самое вооружение (автоматическая скорострельная пушка и ракетная установка) и количество перевозимых людей (6 человек). Единственными отличиями являются пробиваемые шины вместо гусениц у БМП и возможность плавать по воде.

Данное транспортное средство можно использовать лишь в мультиплеере только тем игрокам, которые купили лицензионное коллекционное издание Crysis или оформили предварительный заказ через магазин EAstore. Кроме того, в мультиплеере БТР может использовать только непосредственный покупатель. После того как игрок-покупатель покинет данную техническую единицу, ей смогут воспользоваться члены команды покупателя, а противник сможет её захватить.

Важно отметить, что бронетранспортёр присутствует во всех версиях игры, просто он «заблокирован». При создании и редактировании карт в редакторе уровней Sandbox2 его можно использовать всем независимо от версии игры и типа заказа.